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体内一些代谢物可与某些酶的活性中心外的某个部位非共价可逆结合，引起酶的 构象改变，从而改变酶的活性，酶的这种调节方式称为酶的别构调节，也称为变构调节。受别构调节的酶称为别构酶，引起别构效应的物质称为别构效应剂。酶分子与别构效应剂结合的部位称为别构部位或调节部位。有些酶的调节部位与催化部位存在于同一亚基；有的则分别存在于不同的亚基，从而有催化亚基和调节亚基之分。根据别构效应剂对别构酶的调节效果，有别构激活剂和别构抑制剂之分。别构效应剂可以是代谢途径的终产物、中间产物、酶的底物或其他物质。

别构酶分子中常含有多个（偶数）亚基，具有多亚基的别构酶也与血红蛋白一样，存在着协同效应，包括正协同效应和负协同效应。如果效应剂与酶的一个亚基结合，此亚基的别构效应使相邻亚基也发生别构，并增加对此效应剂的亲和力，这种协同效应称为正协同效应；如果后续亚基的别构降低对此效应剂的亲和力，则称为负协同效应。如果效应剂是底物本身，正协同效应的底物浓度曲线为S形曲线。别构激活剂使别构酶的 S形曲线左移，别构抑制剂使 S形曲线右移。

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