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在人体消化道中寄居的阿米巴原虫有溶组织内阿米巴、迪斯帕内阿米巴、结肠内阿米巴及哈门氏内阿米巴等，只有溶组织内阿米巴具有致病性，其余均为非致病性的共栖型原虫。这些非致病性的共栖型原虫一般不侵入人体组织且不引起临床症状，但如果有大量原虫寄居或宿主防御功能减弱或合并有细菌感染时，也可能会出现症状。

溶组织内阿米巴生活史一般分包囊期和滋养体期。成熟的四核包囊是阿米巴的传染阶段，而滋养体是致病阶段。包囊见于慢性阿米巴病患者或包囊携带者的大便中，人的感染途径多为食入被包囊污染的食物和水而引起。包囊进入消化道后，由于囊壁具有抗胃酸作用，能安全通过胃到达回盲部，在碱性肠液的消化作用下脱囊，发育成为滋养体，大小在10～60μm。滋养体在结肠上端摄食细菌并以二分裂方式增殖，其在肠腔内下移过程中，随着肠内容物脱水和环境改变，形成圆形的包囊前期。滋养体可吞噬红细胞和组织细胞碎片，侵入破坏肠壁组织，引起溃疡。

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