1.蛋白质的一级结构：指多肽链中氨基酸的排列顺序。基本化学键：肽键。

2.蛋白质的二级结构：蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构，即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置，并不涉及氨基酸残基侧链的构象。主要的化学键：氢键。基本结构形式：α-螺旋、β-折叠、β-转角、无规卷曲。

3.蛋白质的三级结构：一条多肽链内所有原子的空间排布，包括主链、侧链构象内容。

化学键：疏水键、氢键、盐键、二硫键、范德华力。

4.蛋白质四级结构：蛋白质分子中各亚基之间的空间排布及相互接触关系。亚基：有些蛋白质由两条或两条以上具有独立三级结构的多肽链组成，其中每条多肽链称为一个亚基。由亚基构成的蛋白质称为寡聚蛋白。

蛋白质的基本结构是氨基酸，氨基酸通过肽键连接形成肽。肽键是前羧后氨间的联合，肽键性质：具有双键性质，不可自由旋转。氨基酸可以分为四类：

（1）非极性R基氨基酸：包括：丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、甲硫氨酸、脯氨酸。

（2）不带电荷的极性R基氨基酸：易溶于水。包括丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、半胱氨酸（含有巯基）、甘氨酸。

（3）带正电荷的R基氨基酸（碱性氨基酸）：包括：赖氨酸、精氨酸、组氨酸。

（4）带负电荷的R基氨基酸（酸性氨基酸）：包括：天冬氨酸和谷氨酸。