A．婴幼儿卡介苗接种；封锁疫情；短程督导化疗；药物预防；切断传播途径

B．新生儿卡介苗接种；封锁疫情；长期督导化疗；药物预防；切断传播途径

C．婴幼儿卡介苗接种；隔离患者；短程督导化疗；药物预防；切断传播途径

D．新生儿卡介苗接种；病例发现；短程督导化疗；药物预防；切断传播途径

E．新生儿卡介苗接种；病例发现；长期督导化疗；药物预防；切断传播途径

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解析：由于结核病不存在母传被动免疫，应及早对新生儿进行卡介苗接种。及时发现肺结核患者，尤其是传染性肺结核患者，并治愈患者是防止结核病传播和预防耐药结核产生的有效措施。所以病例发现是控制结核病流行的重要措施。此题选D。