遗传病的诊断基于特殊的临床综合征和（或）疾病特有的体征，或实验证据证实与疾病有关的基因或基因产物的改变。遗传性疾病的诊断是开展遗传咨询和防治的基础，遗传性疾病的诊断要注意收集以下资料。

1．病史

（1）对有先天性畸形、特殊面容、生长发育障碍、智力发育落后、性发育异常或有遗传性疾病家族史者，应做详细的家系调查和家谱分析，了解其他成员的健康状况。新生儿期出现黄疸不退、腹泻、持续呕吐、肝肿大、惊厥、低血糖、酸中毒、高氨血症、电解质异常以及尿中有持续臭味，应疑为遗传代谢病，并做进一步检查。

（2）记录母亲妊娠史，如胎儿发育情况、母亲有无糖尿病、羊水过多或过少等。糖尿病母亲婴儿畸形发生率高。羊水过多时胎儿常伴有畸形。

（3）应详细询问母亲孕期用药史及病史，弓形虫、风疹及巨细胞病毒感染能造成胎儿器官畸形，但病史不一定与畸形有因果关系。虽然回顾性流行病学调查认为一些药物与畸形有关，但真正能证实的药物致畸因素很少。

2．体格检查头面部注意头围，有无小头畸形、小下颌畸形，耳的大小、耳位高低、眼距、眼裂、鼻翼发育，有无唇裂、腭裂和高腭弓，有无毛发稀疏和颜色异常。注意上部量与下部量比例、指距、手指长度、乳头距离，注意脊柱、胸廓异常，注意关节活动是否正常，注意皮肤和毛发色素、手纹、外生殖器等。注意黄疸、肝脾肿大和神经系统症状。嗅到一些不正常的汗味或尿味等，提示某些遗传代谢病的可能。

3．实验室检查

（1）染色体核型分析：染色体核型分析是经典的细胞遗传检测技术，是将一个处于有丝分裂中期的细胞中全部染色体按大小及形态特征，有秩序地配对排列，观察有无染色体数目或结构异常。染色体核型分析是习惯性流产、不孕不育、性发育落后以及智力低下等患者寻找遗传学病因的常规检测方法。染色体核型分析只能检出染色体数目异常和大片段结构异常，染色体的微缺失、微重复与各类基因突变均无法通过染色体核型分析检出。

（2）荧光原位杂交（FISH）技术：FISH是用荧光素标记的特定DNA作为探针进行原位杂交来检测患者样本中的目的DNA序列。通过荧光显微镜对样品进行观察，能够实时看到探针信号的有无及在染色体上的位置。FISH检查必须预先知道异常发生部位并有针对性地选择特异性探针，只能对个别问题进行分析。FISH技术主要用于染色体上的微小缺失，这些微缺失综合征用传统的染色体分析方法不能识别，包括Prader-Willi综合征、Angelman综合征、Williams综合征等。

（3）基因芯片技术：基因芯片技术是近年遗传学检测的重大进展，它可以通过一次实验对某一样本的整个基因组进行检查。与传统的遗传学检测手段相比，基因芯片检测有如下特点：①检测高通量：能够在一张芯片上检测整个基因组的基因拷贝数变异（copy number variations，CNVs）；②检测分辨率高：传统的核型分析即使分辨率最高，也只能检测大于10Mb（1M=1×10⁶）的片段，而基因芯片能够检测小于100kb（1k=1×10³），甚至1kb的拷贝数变异。SNP芯片能检测单个核苷酸的改变。

在临床上，基因芯片有两类主要用途。①用于检测染色体拷贝数变异的疾病，这是目前临床诊断各类染色体微缺失和微重复综合征的首选方法；②进行单核苷酸多态性分析，用于复杂疾病以及多基因遗传性疾病的临床相关性研究。

（4）DNA分析：基因诊断是在DNA水平上对受检者的某一特定致病基因进行分析和检测，从而达到对疾病进行特异性分子诊断的目的。DNA来源于白细胞或其他组织，包括羊水细胞和绒毛膜绒毛细胞（用于产前诊断）、口腔黏膜细胞（咽拭子）和成纤维细胞（通过皮肤活检获取），从这些组织中能够得到足够的DNA。DNA扩增技术，如聚合酶链反应（PCR），能够从少量的细胞中扩增DNA，然后进行DNA直接测序分析。基因诊断在临床诊断和产前诊断中占有重要地位，能够在基因水平诊断遗传性疾病，也可检测出携带者，是一种快速、灵敏和准确的检测手段。

（5）生化学测定：测定血、尿等体液中的生化代谢物质，例如血糖、血氨、电解质、酮体、乳酸／丙酮酸、尿酸等。近年开展的遗传代谢病串联质谱检测技术（MSIMS）、气相色谱．质谱技术（GCIMS）已逐步成为遗传代谢病的常规检测工具，特别是串联质谱技术，能对微量血一次进行30多种氨基酸、有机酸、脂肪酸代谢性疾病的检测，在临床检验中发挥着重要作用。

测定红细胞、白细胞、皮肤成纤维细胞中酶活性是诊断某些遗传代谢病的重要依据。

4．遗传咨询遗传咨询是由咨询医师和咨询者即遗传性疾病患者本人或其家属，就某种遗传性疾病在一个家庭中的发生、再发风险和防治上所面临的问题进行一系列的交谈和讨论，是家庭预防遗传性疾病患儿出生的最有效的方法，咨询医师需协助先证者明确遗传性疾病的诊断和分类。主要咨询对象应包括：①已确诊或怀疑为遗传性疾病的患者及其亲属；②连续发生不明原因疾病的家庭成员；③疑与遗传有关的先天性畸形、病因不明的智力低下患者；④易位染色体或致病基因携带者；⑤不明原因的反复流产、死胎、死产及不孕（育）夫妇；⑥性发育异常者；⑦孕早期接触放射线、化学毒物、致畸药物或病原生物感染者；⑧有遗传性疾病家族史并拟结婚或生育者。

值得注意的是，先天性疾病和家族性疾病不完全等同于遗传性疾病。所谓先天性疾病（congenital disease）常指个体生来即有异常表型，可为遗传性疾病，但并非都是遗传性疾病，如先天性梅毒、先天性肝炎等，均是由孕母在妊娠期间受到病原生物体感染所致。同样，遗传性疾病亦并非都表现为先天性，某些遗传性疾病出生时无异常表型，要到特定的年龄才发病，如亨廷顿舞蹈病、脊髓性小脑共济失调等。在临床上，严格区分由遗传因素与非遗传因素所造成的先天性畸形（congenital malformation）或出生缺陷（birth defects）有一定的困难，但又十分必要，这将有助于控制和减少遗传性疾病和出生缺陷患儿的出生，有助于提高人口素质，尤其是出生人口素质。

5．预防遗传性疾病是一类严重危害人类身心健康的难治疾患，不仅给家庭及社会带来沉重负担，而且危及子孙后代，直接影响人口素质的提高。由于多数遗传性疾病的治疗仍颇为艰难或昂贵，难以普遍实施。因此，为减少遗传性疾病的发生，广泛开展预防工作就显得格外重要。目前防治的重点主要是贯彻预防为主的方针，做好三级预防，防止和减少有遗传性疾病患儿的发生和出生，或者出生后及早治疗，避免有遗传性疾病的患儿发病。

一级预防：防止遗传性疾病的发生近亲结婚所生子女患智力低下的比例比非近亲婚配的要高150倍，畸形率也要高3倍多，国家法律禁止直系血缘和三代以内的旁系血缘结婚。凡本人或家族成员有遗传性疾病或先天性畸形史、家族中多次出现或生育过智力低下儿或反复自然流产者，应进行遗传咨询，找出病因，明确诊断。在人群或者高危家族及时检出携带者，并在检出后积极进行婚育指导，对预防和减少遗传性疾病患儿的出生具有现实意义。

致病基因携带者是指具有隐性致病基因（杂合子）或平衡易位染色体，且能传递给后代的外表正常的个体。携带者检出的意义在于：①在群体中每种隐性遗传性疾病的发病率虽然很低，但致病基因携带者却相当多，例如苯丙酮尿症的发病率为1︰11000，但人群中的致病基因携带者达1︰50～1︰60；②双亲之一为染色体平衡易位，其后代异常胚胎的几率较高；③对隐性遗传性疾病携带者的检出有助于积极进行婚育指导或产前诊断，对预防和减少遗传性疾病患儿的出生具有现实意义。

二级预防：在遗传咨询的基础上，有目的地进行产前诊断，即通过直接或间接地对孕期胚胎或胎儿进行生长和生物标志物的检测，确定诊断，减少遗传性疾病患儿出生。根据特定的遗传性疾病或者先天缺陷，可用不同的产前诊断方法进行诊断。例如通过观察胎儿表型的形态特征（超声、胎儿镜检查）、染色体检查（细胞遗传学技术）及基因分析或其表达产物测定（酶和生化测定）来诊断。所用标本的采集可由羊膜腔穿刺术、绒毛膜绒毛吸取术、脐带穿刺术和从母血中分离胎儿细胞等方法来完成。

三级预防：遗传性疾病出生后的治疗。新生儿疑有遗传性疾病，出生后即尽可能利用血生化检查或染色体分析作出早期诊断。新生儿疾病筛查是提高人口素质的重要措施之一，通过快速、敏感的检验方法，对一些先天性和遗传性疾病进行群体筛检，从而使患儿在临床上尚未出现疾病表现而其体内生化、代谢或者功能已有变化时就作出早期诊断，并且结合有效治疗，避免患儿重要脏器出现不可逆性损害，保障儿童正常的体格发育和智能发育。目前新生儿疾病筛查正在全国逐步推广，各地主要筛查先天性甲状腺功能减退症和苯丙酮尿症两种导致智能发育障碍的疾病。苯丙酮尿症发病率约为1︰11000，先天性甲状腺功能减退症发病率约为1︰3000，有的地区开展了葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症、先天性肾上腺皮质增生症筛查，个别城市已经开展了串联质谱新技术的遗传代谢病筛查，大大扩大了筛查的疾病谱。新生儿疾病筛查可使患儿出生2～4周内得到确诊。通过后续积极治疗，极大降低了遗传代谢性疾病的危害。