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　　主要是革兰阴性菌感染，以大肠杆菌（E．coli）为主。在首次发作的UTI中80%由之引起。致尿路感染的大肠杆菌借助其P伞（P fimbriae）与尿路上皮细胞的特异受体结合而黏附于上皮；其荚膜抗原（K抗原）具有抵抗吞噬细胞吞噬，抵抗补体对细菌的直接杀伤和溶解的作用；从而加强在组织内之存活；其菌体抗原（O抗原）产生之内毒素并引起发热和炎症反应。

　　除大肠杆菌外其他较常见的细菌是变形杆菌、克雷伯杆菌及副大肠杆菌等，少数为粪链球菌和葡萄球菌。

　　有时由于应用抗生素或机体本身抗菌物质（如补体、抗体、溶菌酶）等的作用，细菌产生变化，即组织中的细菌细胞壁形成障碍，成为球浆体，此称为L型细菌。此时其毒力虽较原菌弱，但可在肾髓质高渗环境下存活，当宿主防御力下降时又可致病，这种L型菌常为慢性尿路感染源之一。

　　除上述细菌感染外，UTI还可由真菌、衣原体、病毒（如腺病毒）引起。

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