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对于青壮年患者有慢性反复发作性右下腹痛、腹泻、腹块、发热等表现的病人配合结肠镜检查、活检和X线检查可确诊。但需除外其他感染性和非感染性肠病。

1．肠结核病变主要累及回盲部，但不呈节段性分布。瘘管形成较少。结核菌素试验阳性，抗结核治疗有效。

2．溃疡性结肠炎根据病人的临床表现、X线检查、结肠镜检查等不难鉴别。活体病理检查发现非干酪性肉芽肿在克罗恩病多见。

3．急性阑尾炎常有转移性右下腹疼痛和麦氏点压痛，血象白细胞计数增高明显，且腹泻少见，可资鉴别。

4．急性出血坏死性肠炎有地区性和季节性，发病前常有不洁饮食史或暴饮暴食史或服用抗生素史。亦可呈节段性分布，但多以空肠病变为主，且腹痛以左上腹和左中腹为主，便血多见。病程短，毒血症明显，很少复发。

5．小肠恶性淋巴瘤若局限在小肠和邻近肠系膜淋巴结者，应作X线检查、腹部B超、CT检查以确诊。

6．胶囊小肠内镜检查有助于小肠疾病（如肿瘤、出血、炎症、溃疡、克罗恩病）的诊断。

7．其他如盲肠癌、细菌性痢疾、阿米巴肠病、小肠淋巴瘤、缺血性肠炎等也应考虑。

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