1、仓库管理应有严格的日常管理制度，保持经常性的检查，保证库房干燥、清洁、通风。要及时采取有效措施调节室内温度和湿度。药材入库前应详细检查有无虫蛀、发霉等情况。贮藏方法和条件可根据药材本身的特性分类保管，如剧毒药必须与非毒性药材分开，专人保管；容易吸湿霉变的药材应特别注意通风干燥；含淀粉、蛋白质、糖类等易虫蛀的药材，应贮存于容器中，放置干燥通风处，并经常检查；少数贵重药材也应与一般药材分开，专人管理，有的应密闭贮存，对易挥发的药材应密闭，有效成分不稳定的不能久贮。

2、霉变的防治措施主要是控制库房的湿度在65%～70%为宜。药材含水量一般应保持在15%以下。

3、害虫的防治。虫害的防治措施可分为物理和化学两类方法。

物理方法包括：

①太阳曝晒、烘烤，注意烘烤药材温度不宜超过60℃，含挥发油的药材不宜烘烤。

②低温冷藏，温度低于-4℃，经过一定时间，可以使害虫致死。

③利用某种药材挥发性的气味，可以防止同处存放的药材虫蛀。例如，牡丹皮与泽泻放在一起，牡丹皮不易变色，泽泻不易虫蛀，利用酒精的挥发蒸气、密封法等亦可防虫。