中枢免疫器官的组成包括骨髓、胸腺：

1、骨髓

骨髓是造血器官，也是各种免疫细胞的发源地，具有分泌造血细胞及生长和分化调节的作用。骨髓中各阶段细胞不断在完成更新、增殖、分化和成熟等发育过程。其原始阶段细胞为多能干细胞（stem cell），可以形成红细胞、粒细胞、巨噬细胞等，以及B淋巴细胞和T淋巴细胞。

2、胸腺

正常胸腺的结构，是发生最早的免疫器官。胸腺对机体免疫功能的建立，以及丧失免疫功能的重建均具有很重要作用，也是T淋巴细胞分化成熟的场所。骨髓产生的部分淋巴细胞在胸腺中继续发育成熟为T细胞，能分泌胸腺素，在促进T细胞分化和成熟过程中，选择性发挥免疫调节作用。T辅助细胞（TH）和T抑制细胞（TS）均在胸腺中形成。胸腺也是机体维持免疫自稳的器官。