颅底的生长发育受到颌面部的一般型生长发育的影响，同时也受到脑生长发育的影响。颅底的生长发育主要由蝶筛软骨结合、蝶骨间软骨结合和蝶枕软骨结合进行，而蝶骨间软骨结合于出生时钙化，蝶筛软骨结合大约在出生后7年钙化。因此其后颅底的中央部分基本上很少进行生长发育，颅底的前方有额骨的生长发育。而蝶枕骨结合在18～20岁左右还可以有所活动。因此可以看到，颅底的后部有生长发育 .

在正畸学中应用头颅定位像时，常用颅底部分以蝶鞍点（S）为中心，向前与鼻根点（N）连线称为前颅底，向后与颅底点（Ba）之连线称为后颅底。

对颅底软骨结合的生长发育产生不利影响时，可出现早期骨化，造成颅底得不到充分生长发育而停止，其结果在正畸临床上可出现中面部或上颌的后缩，并形成反合。对软骨结合的生长发育造成严重影响时，则可出现颅畸形征，如：锁骨颅骨发育不全（cleidocranial dysostosis）等。