生物性污染的危害：

水体受到生物性污染后最常见的危害是居民通过饮用、接触等途径而引起介水传染病的暴发流行，对人体健康造成危害。这类疾病包括霍乱、伤寒、痢疾、肝炎等肠道传染病及血吸虫病、贾第虫病等寄生虫病以及钩端螺旋体病等。水体生物性污染主要来源于人畜粪便和生活污水的排放。

在富营养化水体中藻类大量繁殖聚集成团块，漂浮于水面影响水的感官性状。有些藻类能产生毒素如麻痹性贝毒、腹泻性贝毒、神经性贝毒等，而贝类能富集此类毒素，人食用了毒化的贝类后可发生中毒甚至死亡。藻类毒素一旦进入水中，一般供水净化处理和家庭煮沸不能使之全部失活。

致病性微生物的水污染在发展中国家是水污染的突出问题，值得高度重视。

化学性污染的危害：

1. 汞和甲基汞：最典型的例子为水俣病。

2. 酚：为细胞原浆毒物，在低浓度时能使蛋白质变性，高浓度时则能使蛋白质沉淀。对皮肤黏膜有强烈的刺激腐蚀作用，也可抑制中枢神经系统或损害肝肾功能。

3. 多氯联苯：在水环境中极为稳定，具有长期残留性、生物蓄积性、半挥发性和高毒性，被认为是一类广泛存在的持久性有机污染物。是典型的具有内雌激素样作用的环境分泌干扰物，能拮抗雄激素的作用。最典型的例子为“米糠油中毒事件”。