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1、检验大便常规，注意查原虫（如阿米巴原虫、隐孢子虫）、滴虫、霉菌及各种寄生虫虫卵；必要时以PCR法查常见病原菌；大便培养（需氧菌、厌氧菌）；药敏试验；免疫功能；肝功能；以及血浆白蛋白、前白蛋白、氮平衡。

2、鉴别诊断与各种非感染性腹泻鉴别，如肠易激惹综合征、炎症性肠病、结肠癌、肠息肉。可作乙状结肠镜、纤维结肠镜、钡灌肠X线检查。

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