生物碱主要分布在高等植物中，低等植物只在蕨类、菌类的个别植物中存在生物碱，如麦角菌含有的麦角生物碱。

生物碱在植物体的各个器官均有存在，但对某一种植物来说，张博士医考搜集整理往往是集中在某一器官，如麻黄生物碱——髓部；防己生物碱——根部；黄柏生物碱——树皮部等等。

生物碱在植物中的含量差异很大，如金鸡纳树皮中生物碱的含量在1.5%以上。长春花中长春新碱 的含量仅为百万分之一，美登木中美登木碱的含量仅为千万分之二。因此，生物碱含量达到千分之一以上就算比较高。生物碱含量的高低、有无还受生长环境、季节 等因素的影响，如在欧洲生长的麻黄，麻黄碱的含量很低，而在我国生长的含量较高，尤其山西大同的麻黄含麻黄碱可高达1.6%，并且以秋末冬初采收的含量最 高。

含生物碱的植物大多是数种或数十种共存，如长春花已知含70多种生物碱。由于同一种植物中的生物碱往往来源同一个前体，因此化学结构往往类似，同科同属植物中的生物碱也往往属于同一结构类型。

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