1、中心型卵圆窝型。这是心房间隔缺损中最多见的一种，约占全部病例的80％以上。缺损位于卵圆窝或其附近，周围为心房间隔组织，缺损面积一般较大，直径多为1～4cm.一般为单发，有时是多发的筛状小孔。

2、上腔型静脉窦缺损为高位缺损。缺损位于上腔静脉入口下方，下缘为房间隔，从上腔静脉回流来的血液可以直接流入左、右心房，亦称高位缺损，常常合并右上肺静脉异位引流。

3、下腔型缺损为低位缺损。下缘缺乏心房间隔组织，直达下腔静脉入口处。有较大的下腔静脉瓣，手术时误为间隔下缘，缝合后产生下腔静脉引流入左心房。一般情况下，下腔静脉回流来的血液可同时分流入两侧心房，亦称低位型缺损。

4、混合型。两种或两种以上的缺损同时存在，心房间隔几乎完全缺如，其血流动力学变化与单心房畸形相似，有的称为单心房。