稽留流产属于自然流产的特殊情况，自然流产病因如下：

1、胚胎因素

胚胎或胎儿染色体异常，包括数目异常和结构异常，前者以三体最多见，常见的有13-三体、16-三体、18-三体、21三体和22-三体，其次为单体，三倍体及四倍体少见；后者引起流产并不常见，主要有平衡异位、倒置、缺失和重叠及嵌合体等。

2、母体因素

(1)全身性疾病：严重感染、高热疾病、严重贫血、心力衰竭、血栓性疾病、慢性消耗性疾病、慢性肝肾疾病、高血压等。

(2)TORCH（包括弓形虫病、其他因素、风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒）感染对孕妇影响不大，但可感染胎儿导致流产。

(3)生殖器异常：子宫畸形、子宫肌瘤、子宫腺肌病、宫腔黏连等影响胚胎着床发育而导致流产。宫颈机能不全可导致胎膜早破而发生晚期流产。

(4)内分泌异常：女性内分泌功能异常（如黄体功能不全、高催乳素血症、多囊卵巢综合征等），甲状腺功能减退，糖尿病血糖控制不良等，均可导致流产。

(5)强烈应激与不良习惯：妊娠期无论严重的躯体（如手术、直接撞击腹部、性交过频）或心理（过度紧张、焦虑、恐惧、忧伤等精神创伤）的不良刺激均可导致流产。孕妇过量吸烟、酗酒、过量饮咖啡、二醋吗啡（海洛因）等毒品，均可能导致流产。

(6)免疫功能异常：包括自身免疫功能异常和同种免疫功能异常。

3、父亲因素

有研究证实精子的染色体异常可导致自然流产。但临床上精子畸形率异常增高是否与自然流产有关，尚无明确的证据。

4、环境因素

过多接触放射线和砷、铅、甲醛、苯、氯丁二烯、氧化乙烯等化学物质，均可能引起流产。