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T细胞受体（TCR）主要识别由主要组织相容性复合物（MHC）分子提呈的肽段。这些肽段通常来源于被处理过的蛋白质抗原，可以是体内自身蛋白或外来入侵者如病毒、细菌等产生的蛋白。具体来说，CD4 T辅助细胞识别与MHC II类分子结合的外源性抗原肽，而CD8 细胞毒性T淋巴细胞则识别与MHC I类分子结合的内源性抗原肽。这种特异性识别是适应性免疫应答中的关键步骤之一，有助于激活T细胞并启动针对特定病原体的免疫反应。

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