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对该类疾病进行鉴别诊断往往是比较困难的，我们可以从病史中了解起病情况、疼痛的特征和对疼痛部位进行精确的定位。如疼痛为局部性（在病变部位感觉到且在查体时有压痛点），往往为纤维肌痛症；如疼痛为弥漫性，则原发性纤维肌痛症较为多见。如疼痛由深部组织引起，可见于腰椎慢性骨关节炎引起的腰痛；如疼痛呈放射性，常见于坐骨神经痛；如疼痛为牵涉性，则常见于浆膜炎、肾盂肾炎、骨质疏松症、压迫性骨折或骨髓炎。因疼痛、肌紧张和脊柱旁肌肉压痛而引起的背部活动受限，是所有影响肌肉骨骼和神经系统的疾病所共有的特点。如疼痛在休息时加重，随伸展运动或活动而减轻，则是疼痛起源于纤维肌肉的特征。但内脏牵涉痛则没有该类情况，典型的内脏牵涉痛不会因为活动而加重，也不会因为休息而缓解，通常是持续性的而且会在夜间加重。脊髓神经根和坐骨神经病变引起的疼痛的特征为Valsalva试验阳性（用力呼吸，咳嗽，打喷嚏时疼痛加重），直腿抬高受限，反射消失和皮肤感觉改变。

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