鼠疫杆菌的检验必须严格执行烈性菌管理规则，注意防止气溶胶感染或防蚤叮咬。动物实验应有防护设备，实验用过培养物及器材应及时消毒。

取检材涂片，用甲醇或酒精乙醚混合液固定5～10分钟，然后进行革氏或美兰染色，镜检观察鼠疫杆菌的形态特征。

将检材划线接种于普通琼脂平板上，龙胆紫血琼脂平板及厚金格尔（Hottinger）琼脂平板上。28℃孵育48小时后观察菌落特征，挑取可疑菌落，涂片、染色、镜检。必要时，接种厚金格尔斜面和肉汤，作噬菌体裂解、凝集或沉淀试验等进一步鉴定。确诊第一例鼠疫报告时，须作豚鼠皮下或擦皮接种试验。