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血栓闭塞性脉管炎患者中1～5%有家族史。不少学者发现人类白细胞抗原（HLA）的某些特殊位点与血栓闭塞性脉管炎的发病有关。日本学者发现血栓闭 塞性脉管炎的HLA-J-1-1阳性率为46%，而正常人仅18%.另有报道北京张博士医考整理，血栓闭塞性脉管炎患者的HLA-BW54、HLA- BW52和HLA-A阳性率增高。其中HLA-J和HLA-BW54均受遗传因子支配。

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