黄连素可从黄连、黄柏、三颗针等植物中提取，它具有显著的抑菌作用，常用的盐酸黄连素又叫盐酸小檗碱，黄连素能对抗病原微生物，对多种细菌如痢疾杆菌、结核杆菌、肺炎球菌、伤寒杆菌及白喉杆菌等都有抑制作用，其中对痢疾杆菌作用最强，常用来治疗细菌性胃肠炎、痢疾等消化道疾病，临床主要用于治疗细菌性痢疾和肠胃炎，它的副作用较小。

盐酸小檗碱片的俗称是黄连素，当然还有很多其他的别名，属中成药，为止泻药类非处方药药品，对痢疾杆菌、肺炎双球菌、金葡菌、链球菌、伤寒杆菌及阿米巴原虫有抑制作用，临床主要用于肠道感染、菌痢等，近来还发现盐酸小檗碱片有抗心律失常的作用，体外试验证实黄连素能增强白细胞及肝脏网状内皮系统的吞噬能力，敏感病原菌所致的胃肠炎、细菌性痢疾等肠道感染都可以用盐酸小檗碱片，已经证实很有疗效，深受病患的欢迎。