A．肽聚糖

B．蛋白质

C．脂蛋白

D．核酸

E．脂多糖

解析： 内毒素的主要化学成分是脂多糖，脂多糖为革兰阴性菌细胞壁的外膜成分，由脂质 A、核心多糖及O-特异性多糖构成，具有抗原性和致病性。肽聚糖位于革兰阳性菌和阴性菌细胞壁的胞质周围间隙内，赋予细胞壁以固定形态，其成分由聚糖骨架、四肽侧链及五肽交联桥(革兰阴性菌无五肽交联桥成分)构成。核酸、蛋白质及脂蛋白亦为细菌的构成成分。因此正确答案是E。