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1. 葡萄糖或糖原氧化分解成丙酮酸这个阶段也是在胞液中进行的，与无氧酵解过程基本相同。

2. 丙酮酸氧化脱羧生成乙酰辅酶A胞液中的丙酮酸透过线粒体膜进入线粒体后，经丙酮酸脱氢酶系催化，进行氧化脱羧，并与辅酶A结合而生成乙酰辅酶A.丙酮酸脱氢酶系是一个很复杂的多酶体系。包括丙酮酸脱氢酶（辅酶是TPP）、硫辛酸乙酰转移酶（辅酶是硫辛酸和CoA-SH）、二氢硫辛酸脱氢酶（辅基是FAD），并需要线粒体基质中的NAD+.现已了解，此多酶复合体形成了紧密相连的连锁反应机构，故催化效率较高。

3. 三羧酸循环

（1）三羧酸循环的反应过程：①乙酰辅酶A与草酰乙酸缩合成柠檬酸。乙酰辅酸A在柠檬酸合成酶催化下，与草酰乙酸缩合成柠檬酰辅酶A，后水解成柠檬酸和CoA.此反应在生理条件下是不可逆的。②柠檬酸转变成异柠檬酸。柠檬酸在顺乌头酸酶催化下，先脱水转变为顺乌头酸，再加水、异构成异柠檬酸。此反应都是可逆反应。③异柠檬酸氧化脱羧成α-酮戊二酸。④α-酮戊二酸氧化脱羧生成琥珀酰辅酶A.这一酶系是由α-酮戊二酸脱氢酶、硫辛酸琥珀酰转移酶及二氢硫辛酸脱氢酶组成的复合体，其辅酶及催化方式与丙酮酸脱氢酶系相似，属不可逆的α-氧化脱羧反应，是三羧酸循环的第三个调节点。⑤琥珀酰辅酶A转变成琥珀酸。琥珀酸硫激酶催化此反应。这是三羧酸循环中唯一直接生成高能磷酸键化合物的反应。所生成的GTP经核苷二磷酸激酶催化，可转变为ATP.⑥-⑧三羧酸循环的最后阶段是四个碳的化合物的反应，即琥珀酸转变为草酰乙酸，共有三步：脱氢、加水、再脱氢。琥珀酸脱氢酶（辅基为FAD）催化琥珀酸脱氢生成延胡索酸；延胡索酸酶催化延胡索酸加水生成苹果酸；苹果酸经苹果酸脱氢酶脱氢生成草酰乙酸。

（2）三羧酸循环的反应特点：①三羧酸循环每循环一次消耗一个乙酰基。反应过程中有4次脱氢和2次脱羧反应。糖的有氧氧化过程中能量和CO2主要在三羧酸循环中产生。每循环一周产生12个ATP.②三羧酸循环在线粒体中进行。由于柠檬酸合成酶、异柠檬酸脱氢酶、α-酮戊二酸脱氢酶系及琥珀酸脱氢酶所催化的反应在生理条件下是不可逆的，所以整个循环是不可逆的。③三羧酸循环从草酰乙酸开始，最后仍生成草酰乙酸，虽其数量不变，实际由于它参与其他代谢在不断更新。④异柠檬酸脱氢酶是三羧酸循环的关键酶，也是该循环的主要调节酶，此外，柠檬酸合成酶和α-酮戊二酸脱氢酶体系也具有调节作用。

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